胆总管结石是一常见多发病，随着年龄的增大，发病人数也迅速增加。但主要的原因有如下几种：
继发于胆囊结石、肝内胆管结石;
物理化学因素;
核心作用：若胆汁内有脱落的上皮细胞、炎性渗出物、粘液块、坏死组织块、虫卵、细菌、异物等时，均可成为胆固醇沉淀的核心，形成结石;
感染因素：细菌感染是一个重要原因。细菌感染可引起管壁充血、水肿，内皮细胞脱落、炎性渗出物的蛋白形成支架、脱落的上皮细胞、细菌群落成为核心可形成结石。
代谢因素：胆汁过于浓缩等均有利于胆囊结石的形成;
胆汁郁滞：胆汁郁滞是形成结石的基本条件。奥狄氏括约肌功能异常、胆道胆汁排空障碍等原因，均为结石的形成提供了基本条件。